Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PpardP35396 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpardP35396 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpardP35396 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpardP35396 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpardP35396 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpardP35396 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpardP35396 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpardP35396 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpardP35396 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpardP35396 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpardP35396 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpardP35396 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpardP35396 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpardP35396 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpardP35396 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpardP35396 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpardP35396 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpardP35396 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PpardP35396 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PpardP35396 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpardP35396 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpardP35396 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpardP35396 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpardP35396 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpardP35396 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpardP35396 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpardP35396 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpardP35396 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpardP35396 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpardP35396 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpardP35396 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpardP35396 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpardP35396 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpardP35396 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpardP35396 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PpardP35396 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpardP35396 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpardP35396 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PpardP35396 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpardP35396 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpardP35396 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpardP35396 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpardP35396 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpardP35396 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PpardP35396 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpardP35396 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpardP35396 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpardP35396 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpardP35396 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpardP35396 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpardP35396 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpardP35396 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpardP35396 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpardP35396 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PpardP35396 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpardP35396 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpardP35396 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PpardP35396 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PpardP35396 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PpardP35396 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PpardP35396 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PpardP35396 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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