Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa10P31310 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa10P31310 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms