Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc10P31257 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc10P31257 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc10P31257 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms