Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18525 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18525 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P18525 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18525 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18525 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18525 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18525 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18525 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18525 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18525 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18525 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18525 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18525 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18525 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18525 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18525 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P18525 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms