Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms