Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prf1P10820 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prf1P10820 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prf1P10820 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms