Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Lamc1P02468 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms