Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC2O95347 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC2O95347 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC2O95347 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC2O95347 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC2O95347 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC2O95347 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC2O95347 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC2O95347 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC2O95347 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC2O95347 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC2O95347 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC2O95347 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC2O95347 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC2O95347 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC2O95347 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC2O95347 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC2O95347 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC2O95347 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC2O95347 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC2O95347 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC2O95347 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC2O95347 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC2O95347 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC2O95347 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC2O95347 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC2O95347 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC2O95347 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms