Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40AO75400 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms