Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms