Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac1O09106 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms