Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna3O08545 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna3O08545 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna3O08545 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna3O08545 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna3O08545 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms