Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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