Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h12bG3X9I7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zc3h12bG3X9I7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zc3h12bG3X9I7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms