Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Colca2F8VPY8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colca2F8VPY8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms