Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM2

1700003H04Rik, RIKEN cDNA 1700003H04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003H04RikE9PXM2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700003H04RikE9PXM2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700003H04RikE9PXM2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700003H04RikE9PXM2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms