Protein–RNA interactions for Protein: E9PV26

Prr36, Proline-rich 36, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr36E9PV26 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr36E9PV26 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr36E9PV26 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr36E9PV26 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr36E9PV26 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr36E9PV26 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr36E9PV26 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr36E9PV26 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms