Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Apba1B2RUJ5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms