Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ3A6PVS8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ3A6PVS8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 380.7 ms