Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01549A6NIU2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms