Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc27A2A6Q5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdc27A2A6Q5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms