Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB5Q9Y5E4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB5Q9Y5E4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms