Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4AQ9UMR7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms