Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx6Q9R1R0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx6Q9R1R0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms