Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod3Q9R0E1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod3Q9R0E1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms