Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bcl11aQ9QYE3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcl11aQ9QYE3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcl11aQ9QYE3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms