Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Plxnb3Q9QY40 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxnb3Q9QY40 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms