Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY15

Ddx25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx25Q9QY15 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx25Q9QY15 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx25Q9QY15 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms