Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms