Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Edf1Q9JMG1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms