Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PnkpQ9JLV6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PnkpQ9JLV6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PnkpQ9JLV6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PnkpQ9JLV6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PnkpQ9JLV6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PnkpQ9JLV6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PnkpQ9JLV6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PnkpQ9JLV6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms