Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmx1aQ9JKU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmx1aQ9JKU8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmx1aQ9JKU8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmx1aQ9JKU8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmx1aQ9JKU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmx1aQ9JKU8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmx1aQ9JKU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms