Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Cldn19Q9ET38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Cldn19Q9ET38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Cldn19Q9ET38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Cldn19Q9ET38 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Cldn19Q9ET38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn19Q9ET38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms