Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tfcp2Q9ERA0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms