Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xab2Q9DCD2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms