Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3bQ9DA80 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms