Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp2c55Q9D816 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 342.7 ms