Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4ipQ9D7Y9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slx4ipQ9D7Y9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms