Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Efhd1Q9D4J1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efhd1Q9D4J1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms