Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp5Q9D387 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms