Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spns3Q9D232 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms