Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Chordc1Q9D1P4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chordc1Q9D1P4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chordc1Q9D1P4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chordc1Q9D1P4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chordc1Q9D1P4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Chordc1Q9D1P4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chordc1Q9D1P4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chordc1Q9D1P4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chordc1Q9D1P4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chordc1Q9D1P4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms