Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc96Q9CR92 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc96Q9CR92 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms