Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BBS2Q9BXC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BBS2Q9BXC9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS2Q9BXC9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms