Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC106Q9BWC9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms