Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl27Q99N92 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms