Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krcc1Q99JT5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krcc1Q99JT5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms