Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED2Q99967 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED2Q99967 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.9 ms