Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms