Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp4Q8VHC5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.9 ms